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《水質 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）質量保證和質量控制規(guī)定，空白試驗結果應低于方法檢出限，否則應查明原因，重新分析直至合格之后才能測定樣品。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，降塵實驗室空白試樣是不稱取降塵樣品，按照與降塵試樣的制備相同步驟制備。
《水質 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）樣品的采集和保存規(guī)定，采集的樣品應盡快分析。若不能及時測定，于4℃以下冷藏、避光保存，測定前過濾。
離子色譜法測定無機陰離子時，不被色譜柱保留或弱保留的陰離子干擾F-和Cl-測定時，用強淋洗液進行洗脫。
用離子色譜法測定廢氣中硫酸霧時，當樣品中含有鈣、鍶、鎂、銅、鐵等金屬陽離子時可以通過陰離子樹脂柱交換處理的方法，除去干擾。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣降塵中的水溶性陰離子時，為了防止樣品變質或冰凍，須在集塵缸內加入硫酸銅、防凍液等。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）規(guī)定，測定氯化氫所配的試劑均貯存于玻璃瓶中。
在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產生干擾。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，每次采集樣品應至少帶兩套全程序空白樣品。將同批次裝好吸收液的吸收瓶帶至采樣現場，不與采樣器連接，采樣結束后帶回實驗室待測。