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在離子色譜分析中，進樣體積大，水負峰亦大；淋洗液的濃度越高，水負峰越小。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）的樣品運輸和保存規(guī)定，環(huán)境空氣降塵樣品置于樣品瓶中，在干燥器內(nèi)保存。
《水質(zhì) 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）質(zhì)量保證和質(zhì)量控制規(guī)定，空白試驗結(jié)果應(yīng)低于方法檢出限，否則應(yīng)查明原因，重新分析直至合格之后才能測定樣品。
采用離子色譜法測定水中磷酸鹽，樣品清潔，不存在重金屬、有機物等干擾的水樣，經(jīng)現(xiàn)場過濾后，可直接進樣。
采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，如采樣使用的玻璃纖維濾筒空白值高于檢出限，用實驗用水反復(fù)浸洗濾筒，并超聲清洗，直至測定浸泡水的電導(dǎo)率小于3.0mS/m。
用離子色譜法測定廢氣中硫酸霧時，當樣品中含有鈣、鍶、鎂、銅、鐵等金屬陽離子時可以通過陰離子樹脂柱交換處理的方法，除去干擾。
采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的石英纖維濾筒無需前處理。
離子色譜的電導(dǎo)檢測器內(nèi)，電極間的距離G越小，死體積越小，則靈敏度越低。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜全程序空白試樣的制備是使用與樣品采集同批次的空白濾膜，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）采用堿性吸收液吸收固定污染源廢氣和無組織排放樣品中的氯化氫。